De meeste agrariërs met een boekhoudprogramma verwerken een factuur door hem eerst te betalen en daarna pas in te boeken. Het inboeken wordt vergemakkelijkt door de betalingsgegevens uit het betalingssysteem in te lezen in het boekhoudprogramma. Daarna moeten echter nog handmatig aanvullende gegevens van de factuur in het boekhoudprogramma worden ingevoerd.

Z factuur kan dit proces op de volgende manieren ondersteunen. In de eerste plaats vergemakkelijkt Z factuur het splitsen van een factuur naar verschillende grootboekrekeningen en BTW-tarieven (gegevens op factuurregelniveau) en hoeven deze factuurgegevens dus niet meer handmatig te worden ingevoerd. In de tweede plaats levert Z factuur extra gegevens die gebruikt kunnen worden voor het genereren van management informatie (gegevens over aantallen en volume). In de derde plaats stelt Z factuur u in staat om een verplichtingenadministratie te voeren (gegevens over nog niet betaalde facturen).